马洪琪院士是我国水利水电领域的领军者，在高坝建设、地下工程和高坝通航方面域均作出了突出贡献。 他获省部级以上科技进步奖19项，其中国家科技进步二等奖4项、国家技术发明二等奖1项，获何梁何利科学与技术进步奖、云南省科学技术杰出贡献奖。 由于他对中国和世界大坝建设发展所作出的卓越贡献，对高坝工程数字化、智能化安全建设和促进年轻工程师成长所作出的突出成就，荣获国际大坝委员会终身成就奖。